Icoana făcătoare de minuni a Sfântului Nicolae, ocrotitorul Mănăstirii Grigoriu, se află în proscomidiarul din fața coloanei din dreapta a bisericii principale.
Istoria mănăstirii a păstrat până în zilele noastre, multe minuni vechi și noi ale sfântului, consemnate în manuscrise și publicate parțial în cartea călugărului din Grigoriu, bătrânul Barlaam. Printre altele, sunt descrise următoarele evenimente: În aprilie 1850, o anumită navă a acostat la arsanele mănăstirii pentru a efectua încărcarea lemnului. În timpul încărcării, s-a pornit un vânt puternic, făcând marea atât de agitată încât nava aproape că s-a scufundat. Marinarii, pierzându-și orice speranță, l-au strigat pe Sfântul Nicolae și i-au cerut călugărilor să se roage sfântului. Când a început rugăciunea, vântul s-a potolit și marea s-a liniștit. Marinarii i-au mulțumit sfântului și, mai târziu, i-au dăruit o mică corabie de argint ca simbol al amintirii veșnice, care este atașată și astăzi la icoana Sfântului Nicolae.
Sfântul Nicolae este înfățișat conform tipului consacrat de iconografie, în plină figură, îmbrăcat în mantie, binecuvântând cu mâna dreaptă și ținând o Evanghelie închisă cu mâna stângă. În stânga sfântului se află Hristos, iar în dreapta Sfântului se află Maica Domnului. Aceștia sunt reprezentați cu Evanghelia și, respectiv, cu omoforionul - o referire la miracolul care a avut loc în timpul primului Conciliu Ecumenic de la Niceea, din 325. Deasupra nimbului Sfântului Nicolae, decorat cu frunze de acantus în relief, în trei medalioane se află o inscripție în basorelief, în limba slavonă veche: Sfântul Nicolae. Aceeași inscripție este repetată în limba greacă pe fundalul de aur al icoanei Sfântului Nicolae. Figura sfântului este poziționată în partea din spate a unui arc susținut de piloni, care împart spațiul vertical al icoanei în două zone, fiecare conținând șase figuri de sfinți. Inscripțiile în slavona veche care însoțesc majoritatea figurilor, ajută la identificarea acestora. Mai precis, prima pereche de sfinți, începând de sus - nu sunt alții decât Ioan Gură de Aur și Vasile, urmați de Grigore și Atanasie, Chiril și Spiridon și alte două perechi de sfinți, fără inscripții corespunzătoare. Figurile ierarhilor de la ultimul nivel sunt completate de prezența a doi diaconi, Sfântul Ștefan - în stânga și Sfântul Roman - în dreapta. De asemenea, icoana poartă un strat de vopsea mai târziu, evident din sec. al XVIII-lea, pe veșmânt, pe Evanghelie și pe mâna dreaptă a sfântului.
Inscripția în slavona veche din partea de jos a icoanei, sună astfel: "Deisis a robului lui Dumnezeu în memoria [.....] starețului păcătos". În 1838, prin eforturile proegumenului mănăstirii - Nectarie, icoana a dobândit un decor măiestrit de argint care reproduce iconografia unei icoane manuscrise a lui Nicolae Făcătorul de Minuni. Inscripția care o însoțește spune: "Deisis robului lui Dumnezeu Nectarie / proigumen al mănăstirii Grigoriu / născut pe insula Chios / luna noiembrie 1838".