С переходом в Троицкую келью в жизни отцов произошли большие перемены. В Троицкую келью отцы были направлены их духовником — отцом Арсением, который имел огромное значение в истории русского монашества на Афоне. Его современник и ученик инок Парфений писал о нём так:
"Духовник Арсений живёт на Святой Горе Афон более 20 лет в совершенном нестяжании, в глубочайшей пустыне, не имеющий никакого телесного утешения: пищу употребляет самую постную, не вкушает ни рыбы, ни сыра, ни масла, а спит очень мало, разве один час в сутки, и то сидя. Если бы не он, то от великих скорбей половина наших монахов ушла бы в Россию, но он никому не даёт благословение; а кто без благословения его что-либо сделает или куда пойдёт, то все страдают и пропадают. Живёт он в келье Иоанна Златоуста, в часе ходьбы от монастыря Иверон, в дикой пустыне. Лучше и искуснее сего старца вы не найдёте во всей Афонской Горе; все единогласно вам скажут о нём: русские, болгары, греки и молдаване; у всех велико имя старца Арсения".
В архивах скита Святого Андрея хранится рукопись, в которой сказано следующее:
"Духовник Арсений жил на Иверской земле с учеником Николаем. Занимался рукоделием, делал ложки и отдавал их в монастырь за сухари; пища у него была скромная, рыбы и масла он не ел. Из скита пророка Ильи монахи ходили к нему исповедоваться. Ученик его Николай не показывался, бегал от народа. Приходили к нему исповедоваться и русские, и два брата схимонахи Виссарион и Варсонофий, а духовник Арсений часто приходил и литургию служил. Виссарион направился иеромонахом, продали келью, а другую купили — Троицы, Ставроникиты монастыря".
Арсений, по справедливости, должен считаться родоначальником восстановившегося русского монашества на Афоне, т.к. Виссарион и Варсонофий, также как знаменитый своей деятельностью по восстановлению русских монахов в Пантелеймоновом монастыре, духовник Иероним были учениками Арсения. Духовник и игумен Павел также был духовным чадом отца Арсения. С благословения отца Арсения решились русские в 1839 г. принять приглашение греческой братии Руссика возвратиться в обитель, из которой были изгнаны за три года до этого. После смерти Павла, осиротевшая русская братия монастыря Святого Пантелеймона недоумевала, кто мог бы заменить его. По внушению свыше, Арсений указал на Иеронима, прибывшего на Афон в 1834 г. и поступившего учеником к Арсению.
В 1838 г. Арсения призвали на игуменство в Ильинский скит. Тогда, по его настоянию, поступили в скит и его любимые ученики: Виссарион и Варсонофий, т.к. у Арсения была мысль развить Ильинский скит в большое общежитие, в котором, без помех со стороны греков, можно было бы принимать всех прибывающих из России монахов. Некоторые из соотечественников воспротивились этому плану и изгнали всех приверженцев Арсения из скита. Виссарион и Варсонофий во время этих событий отсутствовали в поездках, а по возвращении также покинули Ильинский скит и вновь поселились в Троицкой келье.
Когда греческая братия монастыря Руссика открыла русским доступ в монастырь, за 8 месяцев бытности духовником Павла число русской братии возросло до 100 человек. В 1841 г. в Руссике обитали уже 200 монахов.
Так появилась необходимость для блага русского монашества иметь на Святой Горе общежитие чисто русское, обособленное от греков. Виссарион и Варсонофий претерпели множество неудач в поисках кельи, пригодной для устройства скита на Афоне. В 1841 г. они обрели келью Серай, бывшие насельники которой, как оказалось, имели связь с Россией, а небесным покровителем её являлся Первопросвятитель России — святой апостол Андрей Первозванный.