Το 1472, ένας αγρότης ονόματι Ιβάν Ντεμέντιεφ, καθώς έκοβε δέντρα, ανακάλυψε μια είσοδο σε μια σπηλιά με την επιγραφή: «Η σπηλιά που οικοδομήθηκε από τον Θεό». Ένας ιερέας ονόματι Ιωάννης, με το προσωνύμιο «Σέστνικ», μετανάστης από τη Μοσχοβία, ήρθε εκεί για να ιδρύσει ένα μοναστήρι. Μετά τον θάνατο της συζύγου του, που πήρε το μοναστικό όνομα Βάσσα, έγινε ασκητής και αποδέχθηκε το μοναχισμό με το όνομα Ιωνάς.
Ο Ιωνάς έσκαψε μια σπηλαιώδη εκκλησία και ζήτησε από τους ιερείς να την αγιάσουν, γεγονός που συνέβη στις 15 Αυγούστου 1473, προς τιμήν της Κοιμήσεως της Υπεραγίας Θεοτόκου. Κατά την αγιασμό, συνέβη ένα θαύμα: μια τυφλή γυναίκα απέκτησε την όρασή της. Η εικόνα που σχετίζεται με αυτό το γεγονός φυλάσσεται στο ιερό του Ναού της Κοιμήσεως.
Ο Άγιος Ιωνάς αγωνίστηκε μέχρι το 1480 και ήρεμα παρέδωσε την ψυχή του στον Κύριο. Στο σώμα του βρέθηκε μια αλυσίδα, η οποία κρεμάστηκε πάνω από τον τάφο του ως μαρτυρία της ασκητικής του ζωής. Τα λείψανα του Αγίου Ιωνά βρίσκονται στις σπηλιές δίπλα στα λείψανα του Αγίου Γέροντα Μάρκου και της Αγίας Βάσσας.
Κατά τη διάρκεια επίθεσης στο μοναστήρι, ένας ιππότης από τη Λιθουανία, κοροϊδεύοντας τα λείψανα, προσπάθησε να ανοίξει τον τάφο της Βάσσας, αλλά κατακάηκε από τη φλόγα που προερχόταν από αυτόν. Τα ίχνη αυτής της φωτιάς είναι ορατά στον τάφο της Αγίας Βάσσας.
