Γεννήθηκε στην πρώτη τετραετία του 14ου αιώνα στην πόλη Βλαντίμιρ στον ποταμό Κλιάζμα με το όνομα Ιάκωβος. Ο πατέρας του, ιερέας Ιγνάτιος, και η μητέρα του Άννα ήταν θεοφοβούμενοι και έδωσαν στον γιο τους ευσεβή ανατροφή. Από την ηλικία των επτά ετών, ο Ιάκωβος άρχισε να μελετά τα ιερά βιβλία και έδειξε επιμέλεια προς τον οίκο του Θεού. Αποδέχθηκε τη μοναχική ζωή στο μοναστήρι προς τιμήν της Γεννήσεως της Υπεραγίας Θεοτόκου, παίρνοντας το όνομα Παχώμιος.
Μετά τον θάνατο του πατέρα του, μένοντας ορφανός, συνέχισε τις ευσεβείς προθέσεις του. Ο Παχώμιος στάλθηκε στην αδελφική φούρνα, όπου εργάστηκε ακούραστα. Ο ηγούμενος του μοναστηριού, βλέποντας την επιμέλειά του, τον έφερε στον Άγιο Αλέξιο, ο οποίος τον χειροτόνησε διάκονο. Ο Παχώμιος υπηρέτησε για πολλά χρόνια στο μοναστήρι της Γεννήσεως και αργότερα έγινε ηγούμενος της Μονής Τσαρέβο-Κωνσταντίνου.
Κατανοώντας ότι η θεία χάρη τον καλούσε σε νέους άθλους, έφυγε μυστικά από το μοναστήρι και πήγε στη Νερέχτα, όπου βρήκε τόπο για να ιδρύσει νέο μοναστήρι. Οι Νερεχτιάνες τον βοήθησαν με χαρά στην οργάνωση του μοναστηριού, και σύντομα χτίστηκε ναός προς τιμήν της Ζωοδόχου Τριάδας.
Ο Παχώμιος φρόντιζε για την αδελφότητα, καθορίζοντας τρόπο ζωής και εισάγοντας αυστηρό κανόνα. Το μοναστήρι έγινε πρότυπο για άλλα, και πολλοί δώρισαν για την κατασκευή του. Πέθανε στις 21 Μαρτίου 1384, σε κόπους και προσευχές, αφήνοντας στην αδελφότητα οδηγίες και ευλογίες.
Η ταφή του ήταν επιβλητική, και τα λείψανά του τοποθετήθηκαν στον Καθεδρικό Ναό της Τριάδας. Μετά την ανακάλυψη των λειψάνων το 1675, άρχισε η τιμή του αγίου, η οποία ενισχύθηκε από πολλές θαυματουργίες που συνέβησαν τόσο κατά τη διάρκεια της ζωής του όσο και μετά τον θάνατό του.
Πολλά θαύματα που σχετίζονται με το όνομα του αγίου συνέβησαν στη Νερέχτα, συμπεριλαμβανομένων θεραπειών από ασθένειες και απελευθερώσεων από δεινά. Το 1848 και το 1853, βοήθησε τους ανθρώπους κατά τη διάρκεια επιδημιών χολέρας, και πολλοί θεραπεύτηκαν μέσω προσευχών προς αυτόν.
Η μνήμη του αγίου εορτάζεται δύο φορές το χρόνο: στις 21 Μαρτίου/3 Απριλίου και στις 15/28 Μαΐου, όταν γίνεται μεγάλη συγκέντρωση προσκυνητών στην εκκλησία της Τριάδας-Συπανόβ.
