Євгеній Сергійович Боткін народився 27 травня 1865 року в Царському Селі в родині відомого лікаря Сергія Петровича Боткіна. Він походив з купецької династії Боткіних, яка відрізнялася глибокою православною вірою та благодійністю. З дитинства в серці Євгенія були закладені добродійства, такі як великодушність і скромність.
Отримавши домашню освіту, у 1878 році він вступив до 2-ї Санкт-Петербурзької класичної гімназії, а в 1882 році став студентом фізико-математичного факультету Санкт-Петербурзького університету. Однак незабаром він обрав медичну професію і вступив до Військово-медичної академії, яку закінчив з відзнакою в 1889 році. З січня 1890 року почав працювати в Маріїнській лікарні для бідних.
У 25 років Євгеній одружився з Ольгою Володимирівною Мануйловою, і в їхній родині народилося четверо дітей. Паралельно з роботою в лікарні він займався наукою і захистив дисертацію на ступінь доктора медицини в 1893 році. У 1897 році він став приват-доцентом з внутрішніх хвороб.
З 1897 року Боткін почав свою лікарську діяльність у громадах сестер милосердя Російського Товариства Червоного Хреста. У 1904 році, під час російсько-японської війни, він вирушив на Далекий Схід, де проявив себе як видатний лікар і отримав високу адміністративну посаду.
Після війни імператриця Олександра Федорівна побажала, щоб він став особистим лікарем царської родини. З 1908 року він служив лейб-медиком Високої двору, залишаючись добрим і уважним до ближніх.
Коли почалася Перша світова війна, він звернувся з проханням направити його на фронт, але імператор доручив йому залишитися при царській родині. У лютому 1917 року, після революції, він залишився з царською родиною, незважаючи на скасування своєї посади.
У квітні 1918 року Боткін викликався супроводжувати царську родину до Єкатеринбурга, де всі вони були розстріляні в ніч з 16 на 17 липня. За кілька років до своєї кончини він отримав титул потомственного дворянина і вибрав девіз для свого герба: “Вірою, вірністю, працею,” що відображало його життєві ідеали та відданість Богу і царській родині.
