Ο Άγιος Νείλος γεννήθηκε στη Δερεβσκάγια Πυάτινα, της πνευματικής κοινότητας Ζαμπέν, και ετάφη στο Μοναστήρι Κρύπετς. Αποσύρθηκε στην έρημο στην περιοχή Ρζέβ, όπου έζησε δεκατρία χρόνια σε νηστεία και προσευχή, τρέφοντας τον εαυτό του με βότανα και βελανίδια. Ο διάβολος τον πείραξε με διάφορες οράσεις, αλλά ο άγιος αντέτεινε σταθερά. Μετά την προσευχή, ο Νείλος έλαβε εντολή να πάει στο νησί Στολόμπενσκι, όπου διευθέτησε ένα κελί και ένα παρεκκλήσι, περνώντας τη ζωή του σε προσευχές και κόπους.
Στο νησί, αντιμετώπισε επιθέσεις από δαίμονες και κακούς ανθρώπους, αλλά πάντα παρέμεινε υπό την προστασία του Θεού. Μια φορά, ληστές τον επιτέθηκαν και τυφλώθηκαν, αλλά μετά την προσευχή του αγίου, ξαναβρήκαν την όρασή τους. Ο Νείλος επέπληξε τους αμαρτωλούς, τους βοήθησε στον δρόμο της μετάνοιας και δέχτηκε δώρα από δίκαιους ψαράδες.
Ο άγιος αγωνίστηκε στο νησί για είκοσι επτά χρόνια, προετοιμάζοντας ένα μέρος για την ταφή του. Πριν από τον θάνατό του, προσευχήθηκε στον Κύριο για κοινωνία με τα Άγια Μυστήρια, και η επιθυμία του εκπληρώθηκε. Το 1554, στις 7 Δεκεμβρίου, παρέδωσε την ψυχή του στον Κύριο, αφήνοντας πίσω του πολλά θαύματα και διδασκαλίες για τους πιστούς.
Η Μονή Νείλου Στολομπένσκι ιδρύθηκε το 1594, και τα λείψανα του αγίου ανακαλύφθηκαν το 1667. Κάθε χρόνο, στις 27 Μαΐου, πραγματοποιείται λιτανεία προς τιμήν του.
