Μετά τον θάνατο του Έλληνα βασιλιά Αρκαδίου, ο οκτάχρονος γιος του Θεοδόσιος έμεινε ορφανός. Ο αδελφός του Αρκαδίου, αυτοκράτορας Γονόριος, διόρισε τον Ανθέμιο ως κηδεμόνα του. Αυτός είχε δύο κόρες. Η μικρότερη είχε κυριευθεί από δαιμόνια, ενώ η μεγαλύτερη, η Απολλινάρια, επιθυμούσε να ακολουθήσει έναν μοναχικό βίο. Αρνήθηκε να νυμφευθεί, επιθυμώντας να υπηρετήσει τον Θεό και ζητώντας από τους γονείς της να φέρουν κοντά της μια μοναχή για να την εκπαιδεύσει.
Βλέποντας την αμετακίνητη επιθυμία της, οι γονείς της συμφώνησαν και έφεραν μια μοναχή στο παλάτι. Όταν ένιωσε έτοιμη πνευματικά, η Απολλινάρια ζήτησε να μεταβεί στην Ιερουσαλήμ, προκειμένου να προσκυνήσει τους αγίους τόπους. Οι γονείς της, αρχικά απρόθυμοι να την αποχωριστούν, αναγκάστηκαν τελικά να συμφωνήσουν, προσφέροντάς της δώρα για το ταξίδι.
Φτάνοντας στην Ιερουσαλήμ, προσευχήθηκε και δώρησε τα υπάρχοντά της σε μια μονή. Στη συνέχεια, επισκεπτόμενη τον Άγιο Μηνά στην Αλεξάνδρεια, αρνήθηκε κάθε τιμή, ενώ προσέφερε δώρα στους φτωχούς. Αγόρασε, ακόμη, ανδρικά μοναστικά ρούχα και μετέβη κρυφά στην έρημο, όπου έζησε με προσευχή και νηστεία, πολεμώντας τα πάθη και τους περιασμούς.
Μερικά χρόνια αργότερα, η αδελφή της στάλθηκε σε μερικούς πεφωτισμένους πατέρες της Εκκλησίας, προκειμένου να βρει θεραπεία. Η Αγία Απολλινάρια, κρύβοντας το αληθινό της όνομα, την επισκέφτηκε και θεράπευσε την αδελφή της. Δεν θέλησε, ωστόσο, να δεχθεί καμιά τιμή για το θαύμα που είχε συντελεστεί και απομονώθηκε προσευχόμενη στο ησυχαστήριό της.
Όταν παρέδωσε το πνεύμα της στον Κύριο, φανερώθηκε η αληθινή της ταυτότητα. Τότε, όλοι δόξασαν τον Θεό για την αγιοσύνη και τη χάρη του προσώπου της. Οι αδελφοί της την έθαψαν με τιμές, ενώ από τα λείψανά της πραγματοποιήθηκε πλήθος θαυματουργικών θεραπειών.
