У світі його звали Миколай Каллівурциз, народився в 1749 році на Наксосі в сім'ї благочестивих батьків. З раннього віку прагнув до очищення серця та ангельського життя. Освіту почав у приходського священника, потім навчався в євангельській школі в Смірні, де оволодів багатьма мовами та знаннями.
У 1770 році повернувся на Наксос, де познайомився зі святим Макарієм Нотаром, який залучив його до підготовки видання святоотцівських книг. У 1775 році прийшов на Святу Гору Афон, прийняв постриг з ім'ям Никодим і почав працювати в монастирі Діонісій.
У 1777 році почав редагувати збірник 'Філокалія' та інші святоотцівські твори. Незабаром перейшов до Пантократорського скиту, де під керівництвом старця Арсенія вивчав Святе Письмо та твори святих отців, віддаючись духовним подвигам.
У 1783 році прийняв схиму і шість років провів у безмовності, після чого знову зайнявся літературною працею. Помер 14 липня 1809 року, причастившись Святих Дарів і перебуваючи в молитві. Похований у келії Скуртеїв у Кареї.
Преподобний Никодим став відомий як аскетичний письменник і видавець святоотцівських писань. Його шанування зросло, і в 1955 році він був канонізований. Пам'ять святого святкується 14 липня.
