Іоан Васильович Попов народився 17 січня 1867 року в місті Вязьмі, Смоленської губернії, в родині священника. 19 січня його охрестив дід, протоієрей Михайло Попов. Він закінчив Вяземське духовне училище та Смоленську духовну семінарію, а потім Московську духовну академію, де став професором на кафедрі патристики.
Іоан Васильович був активним учасником наукового життя, редагував журнал "Богословський вісник" і викладав у Московському університеті. У 1917 році захистив дисертацію "Особистість і вчення блаженного Августина" і став ординарним професором. Він також був членом Помісного Собору Російської Православної Церкви.
Після закриття Московської духовної академії в 1919 році продовжував викладати на неофіційних курсах. У 1924 році був заарештований і засуджений до трьох років позбавлення волі, перебував у Соловецькому таборі, де працював учителем. Він став одним із авторів "Соловецького послання."
У 1931 році його знову заарештували і засудили до заслання. У 1935 році його знову заарештували і засудили до п'яти років заслання. У 1937 році Іоан Васильович був розстріляний за звинуваченням у контрреволюційній діяльності.
До лику святих причислений 30 липня 2003 року. Пам'ять мученика святкується 8 лютого і в Соборах новомучеників і сповідників Руської Церкви.
Величаємо тебе, святий страстотерпець Іоане, і чтимо чесні страждання твої, які ти за Христа претерпів!
