Јован Васиљевич Попов рођен је 17. јануара 1867. године у граду Вјазми, Смоленске губерније, у породици свештеника. 19. јануара крстио га је деда, протојереј Михаил Попов. Завршио је Вјазмску духовну школу и Смоленску духовну семинарију, а затим Московску духовну академију, где је постао професор на катедри патристике.
Јован Васиљевич био је активан учесник у научном животу, уредник часописа "Богословски вестник" и предавао је на Московском универзитету. 1917. године одбранио је дисертацију "Личност и учење блаженог Августина" и постао редовни професор. Такође је био члан Помесног Сабора Руске Православне Цркве.
Након затварања Московске духовне академије 1919. године, наставио је да предаје на неформалним курсевима. 1924. године је ухапшен и осуђен на три године затвора, а налазио се у Соловецком логору, где је радио као учитељ. Постао је један од аутора "Соловецког писма."
1931. године поново је ухапшен и осуђен на прогон. 1935. године поново је ухапшен и осуђен на пет година прогонства. 1937. године Јован Васиљевич је стрељан под оптужбом за контрареволуционарну делатност.
К лику светих је причисљен 30. јула 2003. године. Памјат мученика се обележава 8. фебруара и у Саборима новомученика и исповедника Руске Цркве.
Величамо те, свети страстотерпче Јоване, и частимо честита страдања твоја, која си за Христа претрпео!
