Ο Άγιος Στέφανος ο Νέος γεννήθηκε το 715 στην Κωνσταντινούπολη σε μια ευσεβή χριστιανική οικογένεια. Οι γονείς του, προσευχόμενοι στον Κύριο για τη γέννηση ενός γιου, τον αφιέρωσαν στον Θεό στον ναό της Βλαχέρνας. Εκείνη την εποχή, ο αυτοκράτορας Λέων ο Ισαυρός άρχισε διωγμούς κατά των αγίων εικόνων. Οι γονείς του αγίου, αφού απομακρύνθηκαν από την Κωνσταντινούπολη στη Βιθυνία, τον εμπιστεύτηκαν στον μακάριο Ιωάννη, όπου πέρασε περισσότερα από 15 χρόνια μαθαίνοντας την μοναστική εργασία. Μετά τον θάνατο του δασκάλου του, ο Στέφανος συνέχισε τον ασκητικό αγώνα στην σπηλιά του, και σύντομα σχηματίστηκε μοναστήρι, του οποίου έγινε ηγούμενος.
Ο αυτοκράτορας Κωνσταντίνος Κοπρωνυμος, πιο σφοδρός διώκτης της Ορθοδοξίας, συγκάλεσε οικονοκλαστικό σύνοδο, στην οποία οι εικόνες κηρύχθηκαν είδωλα. Ο Άγιος Στέφανος έγινε γνωστός στην πρωτεύουσα λόγω της δικαίας ζωής του και των θαυμάτων του. Ο αυτοκράτορας, μαθαίνοντας για τις δραστηριότητές του, προσπάθησε να τον προσελκύσει με το μέρος του, αλλά χωρίς επιτυχία. Ο άγιος συκοφαντήθηκε, κατηγορούμενος για συμβίωση με μοναχή, αλλά η ενοχή του δεν αποδείχθηκε. Τελικά, ο άγιος φυλακίστηκε και το μοναστήρι καταστράφηκε.
Στη φυλακή, ο άγιος παρέμεινε πιστός στην Ορθοδοξία, αντικρούοντας τα επιχειρήματα των αιρετικών. Ο αυτοκράτορας διέταξε να εξοριστεί σε ένα νησί, όπου ο άγιος συνέχισε τον αγώνα του στυλίτη. Η φήμη του διαδόθηκε σε όλη την αυτοκρατορία, ενισχύοντας την πίστη του λαού. Ο άγιος μεταφέρθηκε σε φυλακή στο νησί Φάρος, όπου πέρασε 11 μήνες, παρηγορώντας τους φυλακισμένους και προσφέροντας προσευχές.
Μαθαίνοντας για την ίδρυση μοναστηριού στη φυλακή, ο αυτοκράτορας έστειλε τους υπηρέτες του να σκοτώσουν τον άγιο. Ωστόσο, βλέποντας το άγιο πρόσωπό του, έπεσαν στα πόδια του και ζήτησαν συγχώρεση. Ο αυτοκράτορας, μαθαίνοντας την αλήθεια, κατηγόρησε τον άγιο για συνωμοσία και τον έστειλε σε εκτέλεση. Ο άγιος συνελήφθη και ρίχτηκε σε μια τάφρο όπου θάβονταν οι εγκληματίες. Το επόμενο πρωί, ένα πυρακτωμένο σύννεφο εμφανίστηκε πάνω από το όρος Αυξεντία και μια καταιγίδα χτύπησε την πρωτεύουσα, επηρεάζοντας πολλούς.
