Яків Васильович Шестаков народився 28 квітня 1858 року в селі Камасино Пермської губернії в родині священника. У 1873 році закінчив Духовне училище, а в 1879 році — Пермську Духовну семінарію. З 1879 року працював учителем і правознавцем у земському училищі, потім у Юксеївському пермському училищі. У 1887 році був рукоположений у священики і служив у різних церквах, включаючи церкву села Хохловка та церкву Успіння Пресвятої Богородиці в Чердині. У 1891 році став благочинним і правознавцем Кудимкарського училища, а також спостерігачем комі-пермяцьких церковно-парафіяльних шкіл. У 1899 році вийшов за штат і переїхав до Пермі, де продовжив викладати та збирати кошти на будівництво церков і монастирів.
Отець Яків організував комісію з перекладу книг на комі-пермяцьку мову та видавав літературу, включаючи абетку та Літургію. Він також публікував статті в різних журналах і збирав фольклор Прикам'я. На початку XX століття звернув увагу на проблему збереження культурної спадщини і запропонував створити Пермський єпархіальний церковно-археологічний комітет. У 1909 році переїхав до Санкт-Петербурга, працюючи в цензурному комітеті Святого Синоду.
Багато подорожував, збираючи факти та описуючи події, що стало основою для його спогадів 'Літопис отця Якова Компинського.' У 1918 році був арештований і розстріляний червоноармійцями, збереглися свідчення про його поховання на Хохловському кладовищі.
