Яков Васильевич Шестаков родился 28 апреля 1858 года в селе Камасино Пермской губернии в семье священника. В 1873 году окончил Духовное училище, а в 1879 году — Пермскую Духовную семинарию. С 1879 года работал учителем и законоведом в земском училище, затем в Юксеевском пермяцком училище. В 1887 году был рукоположен во иерея и служил в различных церквях, включая церковь села Хохловка и церковь Успения Пресвятой Богородицы в Чердыни. В 1891 году стал благочинным и законоведом Кудымкорского училища, а также наблюдателем коми-пермяцких церковно-приходских школ. В 1899 году вышел за штат и переехал в Пермь, где продолжал преподавать и собирать средства на строительство церквей и монастырей.
Отец Яков организовал комиссию по переводу книг на коми-пермяцкий язык и издавал литературу, включая азбуку и Литургию. Он также публиковал статьи в различных журналах и собирал фольклор Прикамья. В начале XX века обратил внимание на проблему сохранения культурного наследия и предложил создать Пермский епархиальный церковно-археологический комитет. В 1909 году переехал в Санкт-Петербург, работал в цензурном комитете Священного Синода.
Много путешествовал, собирал факты и описывал события, что стало основой для его воспоминаний «Летопись отца Иакова Компинского». В 1918 году был арестован и расстрелян красноармейцами, сохранились свидетельства о его погребении на Хохловском кладбище.
