Пресвітер
Народився 15 жовтня 1881 року в Москві. Його батько, Михайло Ніконов, працював землеміром. У 1902 році закінчив Московське комерційне училище і з 1903 року служив в армії. У 1905 році залишив службу і вступив до Московської духовної академії, яку закінчив у 1910 році.
З 1911 по 1914 рік був учителем у Данкові Рязанської губернії. З початком Першої світової війни був призваний до армії і служив прапорщиком у 11-й Сибірській стрілецькій дивізії. У 1917 році переведений до 712-го полку, розташованого в Пінських болотах.
З грудня 1917 року по липень 1918 року командував взводом караульної роти в Данкові і був помічником військового керівника. У 1918 році відновив викладацьку діяльність. У 1921 році став псаломщиком, а в кінці серпня 1922 року був рукоположений у священники і служив в Успенській церкві підмосковного міста Клин.
У травні 1922 року виник обновленський розкол. Священик Олексій Ніконов разом зі священиком Олексієм Воробйовим були арештовані 26 вересня 1924 року за звинуваченням в організації нелегального зібрання віруючих. 2 жовтня 1924 року родичі арештованих принесли передачу з запискою.
16 жовтня священик Олексій Ніконов був викликаний на допит, де заперечував участь у нелегальному зібранні. Оскільки його провину не вдалося довести, він перебував у Бутирській в'язниці кілька місяців. 27 лютого 1925 року був засуджений до висилки в Нарынський край на два роки.
Після відбування терміну заслання йому було заборонено проживати в шести великих областях країни. Він оселився в селі Спас-Дощатий і почав служити в Преображенській церкві, проявляючи себе відданим пастирем Церкви Христової.
У лютому 1930 року був арештований за звинуваченням в антирадянській діяльності і ув'язнений у Зарайському адміністративному відділі. 10 лютого його допитали, і він заявив, що не виступав проти радянської влади. На підставі свідчень було складено обвинувачувальний акт.
20 січня 1937 року Особливе засідання при НКВД засудило його до ув'язнення в виправно-трудовий табір строком на п'ять років. Він був відправлений до Севжелдорлагу і помер 29 жовтня 1938 року. Його тіло було поховано на кладовищі села Килтово Княжпогостського району Республіки Комі.
