Η επίγεια πατρίδα του θεϊκού Φιλοθέου, ο οποίος ονομάστηκε Θεόφιλος κατά το άγιο βάπτισμα, ήταν η Χρυσόπολη στη Μακεδονία. Οι γονείς του, αφού εγκατέλειψαν την Ελατία, εγκαταστάθηκαν στη Χρυσόπολη, όπου ο πατέρας του Φιλοθέου πέθανε, αφήνοντας τα παιδιά ορφανά. Η μητέρα, υποφέροντας από την καταπίεση των Τούρκων, προσευχήθηκε για τη σωτηρία των παιδιών της. Θαυματουργικά, οδηγήθηκαν έξω από τη φυλακή από την Μητέρα του Θεού και μεταφέρθηκαν σε ένα μοναστήρι στη Νεάπολη, όπου έλαβαν μοναστικούς όρκους. Η μητέρα, αγνοώντας τη μοίρα των παιδιών της, επίσης εισήλθε σε μοναστήρι και τόνισε ως μοναχή με το όνομα Ευδοκία. Συναντώντας σε μια εορτή της εκκλησίας, αναγνώρισαν ο ένας τον άλλον και δοξάσαν τον Θεό για την θαυμαστή επανένωσή τους.
Ο Φιλοθέος, διακεκριμένος από την ταπεινότητα και την υπακοή, αντιμετώπισε πειρασμούς από μία από τις μοναχές, αλλά παρέμεινε σταθερός απέναντι στους πειρασμούς της. Μετά από αυτό, αποφάσισε να εγκαταλείψει το μοναστήρι και πήγε στο Άγιο Όρος του Άθω, όπου εντάχθηκε στην αδελφότητα της Μονής Διονυσίου. Αργότερα, αναζητώντας την ησυχία, αποσύρθηκε στην έρημο, όπου δέχθηκε επίθεση από τον Σατανά αλλά παρέμεινε αβλαβής. Ο Φιλοθέος επίσης σώθηκε από ληστές προσευχόμενος στον Θεό για προστασία.
Φτάνοντας σε βαθιά γεράματα, αυστηρά απαγόρευσε στους μαθητές του να θάψουν το σώμα του, επιθυμώντας να αφεθεί στα θηρία να το κατασπαράξουν. Ωστόσο, ο Θεός δόξασε τα λείψανά του, και ένας γέροντας, βλέποντας φως από το κρανίο του Φιλοθέου, το πήρε και, λαμβάνοντας καθοδήγηση σε όνειρο, το επέστρεψε στους μαθητές. Ο μακάριος Φιλοθέος εκοιμήθηκε στις 21 Οκτωβρίου και τώρα απολαμβάνει την ευτυχία στο φως των αγίων, δοξάζοντας την Αγία Τριάδα.
