Преподобни Дионисије рођен је 26. септембра 1866. године у селу Сумино, Тверска губернија. 24. септембра 1905. године постао је искушеник у Нил-Столобенској пустињи, где је служио као свештеник. 10. јануара 1910. године пострижен је у монаштво именом Евфимије, а касније у шему именом Дионисије. Живео је у обитељи до њеног затварања 1927. године.
Сергеј Федорович Комаров, богат сељак и добротвор Нил-Столобенске обитељи, позвао је оца Дионисија да живи на свом имању, где је почео да прима локално становништво које је тражило благослов и савет. Отац Дионисије помазивао је болесне уљем из лампаде.
Почетком 1930. године извршен је претрес у кући где је живео шемонах, али није ухапшен. Међутим, убрзо је ухапшен и одведен у затвор. На испитивањима је потврдио да су му долазили многи људи по помоћ и изразио је своје мишљење о совјетској власти као антихристовој.
6. јуна 1931. године, Колегија ОГПУ осудила га је на смрт. Шемонах Дионисије је стрељан 10. јуна 1931. године и сахрањен је у неозначеној гробници на Ваганјковском гробљу у Москви.
