Священномученик Иоанн родился в 1873 году в семье псаломщика Льва Панкова. С 1900 года он был учителем мужского училища в Ливнах Орловской губернии. Рукоположен во священника, с 1915 года служил в Троицком храме села Усть-Нугрь и был законоучителем в начальных училищах. В 1918 году, после захвата власти безбожниками, священник Иоанн столкнулся с преследованиями со стороны солдата Тихона Кутузова, который захватил мельницу, принадлежащую Оптиной пустыни.
В Великую Субботу пьяный Кутузов пришел к священнику, чтобы попросить прощения. Однако, в первый день Пасхи, 22 апреля, крестьяне пришли выселить его, и Кутузов, открыв огонь, убил двух крестьян. В ответ разъяренная толпа убила его. Утром 26 апреля священника Иоанна обвинили в подстрекательстве к мятежу, и он был расстрелян вместе с сыновьями: Николаем и Петром. Тела их оставались непогребенными в течение недели, а затем были похоронены неподалеку от храма. Имущество священника было разграблено, и над церковной дарохранительницей было совершено кощунство.
